如下是薄层层析法的一些优点：
1.需要的设备更少
2.需要的分离时间更短
3.对材料敏感性更强
4. 薄层层析法样本的检测极限大约要比纸层析法低一个小数位，并且，分析所需的样本数目较少。
5. 在纸层析检验中，纤维素十分容易被破坏，因而腐蚀剂喷雾不能被用于鉴定实验，但对于薄层层析法而言，则不存在这一难题。
6. 可用吸附剂资源丰富，因而薄层层析法被广泛用于吸附、分离以及离子交换层析。
7. 相比于纸层析法，薄层层析法的个体样板不容易扩散，因而检测敏感度更强。
8. 被分离的成分可以通过金属粉末涂料的刮擦来达到恢复，同时，点状或区域的量化分离也可以得到实现。
9. 无机吸附背景下不透明，因而我们可以在检测鉴定中通过紫外光来识别每一种成分。
10. 薄层层析法可以在较厚的层析吸附剂的作用下用于预备性分离。